納米磁珠技術逐漸成血漿蛋白組質譜主流?
10月下旬,第23屆國際蛋白組學年會即HUPO2024,在德國東南部充滿巴洛克風格建筑的歐洲小城的德累斯頓舉辦。
HUPO2024是歷年來人數(shù)最多的一次,參與人數(shù)超過1800人,其中來自歐洲的參會者最多。
歐洲是世界蛋白組學的一座高峰。質譜一直是蛋白質研究的黃金標準。質譜儀通過讀取離子的質荷比來識別分子。在電離蛋白質分子,將其碎裂成更小的肽并測量其質荷比后,將得到的質譜與蛋白質序列數(shù)據(jù)庫進行匹配,以確定樣品中存在的蛋白質的身份。
質譜蛋白組學大隊列正拉開帷幕。自從2020年開始,血漿蛋白組學前處理創(chuàng)新逐漸走向商業(yè)化(類如Seer Proteograph?),血漿蛋白檢測深度從幾百個蛋白提升到幾千種蛋白。隨著2023年賽默飛發(fā)布最新款高分辨質譜儀Atral,血漿蛋白組學的通量也達到100SPD。開展血漿蛋白組大隊列的前提已經(jīng)成熟。當今蛋白組學的扛大旗人——德國馬普所Matthias Mann教授。Mann組正在用Astral開展一個5萬人的血漿蛋白組大隊列。曾幾何時,在超多重血漿蛋白組學,Seer占據(jù)非常有利的位置,一度有望成為類似于10X Genomics單細胞基因組這樣的爆款??上в捎谄洚a(chǎn)品定價過高、通用性差、營銷策略不當?shù)鹊仍?,導致其商業(yè)化進程緩慢,市場遲遲無法打開。管理層對市場反饋也基本置之不理。
這給其他公司留出了反應的時間。在HUPO2024上紛紛亮相。
瑞士老牌蛋白組學公司Biognosys和布魯克聯(lián)合推出了基于納米磁珠技術的P2富集(https://biognosys.com/resources/truediscovery-introducing-the-p2-plasma-enrichment-system/),這種新穎的 P2 血漿蛋白質組學方法在先前發(fā)表的 5 種癌癥血漿樣品組中實現(xiàn)了 7,000 種蛋白質的蛋白質組覆蓋,在布魯克 timsTOF? HT 質譜儀上表現(xiàn)出最高的重現(xiàn)性、前所未有的低豐度蛋白質富集和無與倫比的通量。但只接受對外提供蛋白組數(shù)據(jù)檢測服務,服務價格在500歐元一個樣本。放在歐洲,這已經(jīng)是比較便宜的價格了。
丹麥的Evosep也推出了基于納米磁珠富集的血漿蛋白組學方案(https://www.evosep.com/applications/plasma/),聯(lián)合他們的Evosep液相設備,可以實現(xiàn)超過3000種的血漿低豐度蛋白組檢測。
德國的PreOmics 蛋白組前處理公司,順勢推出了自己版本的納米磁珠富集產(chǎn)品(iST-Enrich https://www.preomics.com/products/enrich-ist),加入了這場戰(zhàn)役,可以實現(xiàn)超過2000種的血漿低豐度蛋白組檢測。
在中國,也有納米磁珠專家進入蛋白組學領域,其中廈門普睿邁格生物科技有限公司依托自己強大的磁珠表面修飾技術,也推出了多種納米磁珠富集血漿血清的產(chǎn)品(http://m.5000js.com/Product/8096211554.html),可以實現(xiàn)近4000種的血漿低豐度蛋白組檢測。此外,來自芝加哥大學的 Nanomics 珞米生命科技、來自復旦大學的鄧春暉教授/百趣生物,也在該領域不斷開拓。
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