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基于質(zhì)譜的尿液蛋白質(zhì)組學(xué)最新進(jìn)展:非侵入性生物標(biāo)志物研究的突破

2025-3-6 18:57:57點(diǎn)擊:





概述

近年來,基于質(zhì)譜(Mass Spectrometry, MS)的尿液蛋白質(zhì)組學(xué)研究取得了顯著進(jìn)展。尿液因其非侵入性采集成分復(fù)雜低的特點(diǎn),成為疾病生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的理想樣本。本文總結(jié)了近十年尿液蛋白質(zhì)組學(xué)在技術(shù)方法、疾病研究及臨床應(yīng)用中的核心進(jìn)展。

尿液蛋白質(zhì)組學(xué)的優(yōu)勢(shì)

  1. 非侵入性:無需創(chuàng)傷性采樣,適用于大規(guī)模篩查和長期監(jiān)測(cè)。
  2. 成分簡單:相比血清/血漿,尿液蛋白質(zhì)組復(fù)雜度低,更易檢測(cè)低豐度蛋白。
  3. 動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè):可通過不同時(shí)間點(diǎn)(晨尿、隨機(jī)尿、24小時(shí)尿)采集,反映生理或病理變化。
  4. 多器官來源:尿液中蛋白質(zhì)不僅來自泌尿系統(tǒng),還源于全身器官(如肝臟、腎臟),為遠(yuǎn)隔器官疾病研究提供窗口。

尿液蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程

圖1. 尿液蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程

關(guān)鍵技術(shù)進(jìn)展

1. 質(zhì)譜分析技術(shù)

技術(shù) 優(yōu)勢(shì) 局限
MALDI-TOF-MS 高通量、快速分析 需結(jié)晶樣本,靈敏度較低
CE-MS 低成本、高分辨率 樣本量小,不適合高分子量蛋白
LC-MS/MS 高靈敏度和準(zhǔn)確性,支持深度覆蓋(1000-3000種蛋白) 耗時(shí)、需復(fù)雜前處理

2. 數(shù)據(jù)采集模式

  • 靶向質(zhì)譜(MRM/PRM):精準(zhǔn)定量特定蛋白(如膀胱癌標(biāo)志物ADAM28)。
  • 數(shù)據(jù)非依賴性采集(DIA):全蛋白質(zhì)組覆蓋,適用于未知標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)。

圖2. 近10年尿蛋白組學(xué)研究時(shí)間表

疾病研究的突破性應(yīng)用

1. 膀胱癌

  • 標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):α1-抗胰蛋白酶(A1AT)、ADAM28等蛋白顯著上調(diào),可作為診斷或預(yù)后標(biāo)志。
  • 外泌體分析:尿液外泌體的蛋白質(zhì)譜與腫瘤進(jìn)展相關(guān),如EGFR信號(hào)通路蛋白。
  • 案例:Carvalho等人通過LC-MS/MS監(jiān)測(cè)病程,發(fā)現(xiàn)了復(fù)發(fā)預(yù)測(cè)標(biāo)志物組合。

2. 糖尿病腎病

  • 機(jī)制研究:溶酶體蛋白異常提示腎臟炎癥,血管細(xì)胞黏附分子(VCAM-1)水平與疾病進(jìn)展相關(guān)。
  • 標(biāo)志物驗(yàn)證:CKD273分類器可預(yù)測(cè)2型糖尿病患者的腎病風(fēng)險(xiǎn)。

3. 其他疾病

  • COVID-19:尿液病毒相關(guān)蛋白檢測(cè)輔助無癥狀感染者篩查。
  • 神經(jīng)系統(tǒng)疾病:尿液中特定肽段(如神經(jīng)肽片段)與阿爾茨海默癥相關(guān)。

尿液糖蛋白與肽組學(xué)研究

糖蛋白組的分析

  • 技術(shù):通過親水作用色譜(HILIC)富集糖肽,結(jié)合PNGase F去糖基化確認(rèn)糖基化位點(diǎn)。
  • 應(yīng)用:前列腺癌中糖基化PSA的診斷價(jià)值;肝癌患者尿液外泌體糖基化譜的定量分析。

肽組學(xué)的進(jìn)展

  • 內(nèi)源性肽:肽段片段可反映疾病特異性酶切活動(dòng)(如腎癌中膠原降解肽的積累)。
  • 技術(shù)挑戰(zhàn):需結(jié)合CE-MS、LC-MS等多平臺(tái)提升檢測(cè)覆蓋率和靈敏度。

挑戰(zhàn)與展望

主要挑戰(zhàn)

  1. 樣本標(biāo)準(zhǔn)化:個(gè)體差異、采集時(shí)間、蛋白/肌酐比值歸一化方法需統(tǒng)一。
  2. 技術(shù)限制:低豐度蛋白檢測(cè)靈敏度不足;糖肽與磷酸化肽的高通量分析困難。
  3. 臨床轉(zhuǎn)化:標(biāo)志物驗(yàn)證需大規(guī)模隊(duì)列,且需簡化實(shí)驗(yàn)步驟以適配臨床檢測(cè)。

未來方向

  • 多組學(xué)整合:聯(lián)合基因組、代謝組數(shù)據(jù)提升標(biāo)志物特異性。
  • AI驅(qū)動(dòng)分析:機(jī)器學(xué)習(xí)加速標(biāo)志物挖掘與分類模型構(gòu)建。
  • 即時(shí)檢測(cè)(POCT):開發(fā)便攜式質(zhì)譜或微流控芯片實(shí)現(xiàn)床邊檢測(cè)。

結(jié)論

尿液蛋白質(zhì)組學(xué)為非侵入性診斷和精準(zhǔn)醫(yī)療提供了獨(dú)特工具。隨著質(zhì)譜技術(shù)和數(shù)據(jù)分析的進(jìn)步,其在癌癥、代謝性疾病及罕見病中的應(yīng)用將更加廣泛。標(biāo)準(zhǔn)化流程的建立與跨學(xué)科合作將是推動(dòng)臨床轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵。應(yīng)用于蛋白組學(xué)的磁珠請(qǐng)參考http://m.5000js.com/Product/MSpretreatment/proteomics/


圖片來源及參考文獻(xiàn)

  1. Joshi, N. et al. Clin Proteom 21, 14 (2024). 原文鏈接
  2. 文中示意圖基于參考文獻(xiàn)內(nèi)容繪制,技術(shù)對(duì)比表格為原創(chuàng)整理。



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