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磁珠法細(xì)胞分選的幾個考慮因素

2020-10-4 10:38:09點擊:



       FACS和磁性細(xì)胞分選比離心要特異得多,因為這些方法利用抗體來識別目標(biāo)細(xì)胞。利用FACS,細(xì)胞可根據(jù)幾個抗原的表達(dá)來分離。磁性分選則僅限于1-2個抗原,但優(yōu)點不少。它的平臺更為簡單,成本要低得多,并且處理時間也更短。也許你正躍躍欲試,那么,你需要考慮以下四個因素。

       從復(fù)雜的細(xì)胞混合物中分離出特定的細(xì)胞,是研究人員經(jīng)常要面對的挑戰(zhàn)。就目前而言,三種應(yīng)用最廣泛的技術(shù)是:離心、熒光激活細(xì)胞分選(FACS)和磁性細(xì)胞分選。離心是最便宜的,但也最不特異,主要依靠細(xì)胞的物理特征(如密度)進(jìn)行分離,而基于表型分離細(xì)胞的能力有限。
       FACS和磁性細(xì)胞分選比離心要特異得多,因為這些方法利用抗體來識別目標(biāo)細(xì)胞。利用FACS,細(xì)胞可根據(jù)幾個抗原的表達(dá)來分離。磁性分選則僅限于1-2個抗原,但優(yōu)點不少。它的平臺更為簡單,成本要低得多,并且處理時間也更短。也許你正躍躍欲試,那么,你需要考慮以下四個因素。

(1)樣品組成
       若你了解樣品混合物的組成,則意味著實驗?zāi)軌蚝芎玫匾?guī)劃和開展。對于磁性細(xì)胞分選而言,這尤為重要,因為熟悉不同的細(xì)胞群體可幫你最大限度提高分離的純度和產(chǎn)量。比較兩個樣品的情況并不少見吧,比如,一個是對照,一個經(jīng)過處理。處理后的樣品可能有著不同比例的目標(biāo)細(xì)胞,這意味著你需要調(diào)整試劑,才能達(dá)到類似的純度。這同樣適用于標(biāo)志物上調(diào)或下調(diào)的情況。

(2)陽性分選還是陰性分選?
       磁性細(xì)胞分選有兩種策略:陽性和陰性分選。簡單地說,陽性分選就是選出想要的,而陰性分選就是選出不想要的,留下想要的。這個選擇取決于你的特定需求,不過也需要考慮幾個因素:
       作為FACS之前的富集步驟。在處理復(fù)雜的細(xì)胞群體時,一種有效的方法是先陽性選擇,再進(jìn)行FACS。例如,對于低頻率的目標(biāo)如小鼠樹突狀細(xì)胞(DC),你可以用CD11c結(jié)合的磁珠來富集整個DC部分,再通過FACS分選出CD8+和CD11+亞群。
       功能研究。在開展陽性分選時,分離出的細(xì)胞攜帶了分選用的磁珠,除非二次處理才能去除。在大多數(shù)情況下,這都不是問題。不過,如果磁珠有阻斷或激活的性能,或者你已經(jīng)發(fā)現(xiàn)陽性選擇對你的實驗讀數(shù)有影響,那么陰性選擇可能更適合。

(3)計算純度和產(chǎn)量
       在你分選出細(xì)胞之后,你可能需要驗證它的純度和產(chǎn)量。純度定義為收集到的目標(biāo)細(xì)胞的比例,可通過流式細(xì)胞儀來分析。產(chǎn)量則定義為回收到的目標(biāo)細(xì)胞相對于原始樣品中目標(biāo)細(xì)胞的比例。人們可能使用不同的方法來計算這一參數(shù)。有些人在將樣品放入磁場前后計算目標(biāo)細(xì)胞的數(shù)量,有些人則計算整個過程的產(chǎn)量。無論你使用哪種方法,它都報告為分選后目標(biāo)細(xì)胞的數(shù)量/分選前目標(biāo)細(xì)胞的數(shù)量。切記,不要使用細(xì)胞總數(shù)作為分母。

(4)尋找純度和產(chǎn)量之間的最佳平衡點
       磁性分選的本質(zhì)是在純度和產(chǎn)量之間尋找一個最佳的平衡點。當(dāng)你提高純度,產(chǎn)量就會下降,反之亦然。對于陽性分選,若希望最大限度提高純度,你可以減少磁珠的量,或增加分離次數(shù)。若希望提高產(chǎn)量,則增加磁珠的量,或減少分離次數(shù)。

       當(dāng)然,細(xì)胞分選實驗還是頗有挑戰(zhàn)性的,希望這里討論的tips能幫助你獲得最佳的結(jié)果。

(作者:BioLegend公司產(chǎn)品經(jīng)理:Miguel A. Tam博士)

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