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免疫共沉淀技術(shù)用于探索可能的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機制

2019-4-6 11:33:39點擊:


在從事細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的研究過程中我們常常需要探尋新的通路。在縱橫交錯,紛繁復(fù)雜的cross-talk中如何篩選可能的路徑是signal transduction領(lǐng)域永恒的話題,而免疫共沉淀技術(shù)則是常用而簡便的方法之一。

1. 免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)技術(shù)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。它能確定兩種蛋白質(zhì)在完整細胞內(nèi)生理性的相互作用。

2. IP 利用抗原蛋白質(zhì)和抗體的特異性結(jié)合或細菌蛋白質(zhì)的“prorein A"特異性地結(jié)合到免疫球蛋白的FC 片段揭示待檢蛋白之間的相互關(guān)系。

以檢測某受體與JAK-STAT是否相關(guān)為例,實驗前需要提前預(yù)測Receptor X可能與JAKs中的哪一個結(jié)合(激活)。然后用X受體的抗體去拉復(fù)合物,再用JAK的抗體去進行WB檢測。如果兩種蛋白有相互作用,就會以復(fù)合物的形式存在于樣品中。需要了解的是,用A蛋白的抗體去沉淀A蛋白,這時候沉淀下來的可能是A蛋白,也可能是A和其他蛋白的復(fù)合體。然后用B蛋白的抗體去檢測沉淀下來的樣品(WB),如果檢測到B蛋白,就說明A蛋白和B蛋白是形成復(fù)合體的。具體的實驗中,可以把A當作受體把B當做JAK,也可以反過來。與此同時,也應(yīng)該檢測受體激活的時候JAK-STAT是否同步激活,以及阻斷JAK-STAT以后受體的下游信號是否也被阻斷,這些都是證明可能存在的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的直接的證據(jù)。

3. 其優(yōu)點為:
(1)相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的,處于天然狀態(tài);
(2)蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進行的,可以避免人為的影響;
(3)可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復(fù)合物。

4. 其缺點為:
(1)可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用;
(2)兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合,而可能有第三者在中間起橋梁作用;
(3)必須在實驗前預(yù)測目的蛋白是什么,以選擇最后檢測的抗體,所以,若預(yù)測不正確,實驗就得不到結(jié)果,方法本身具有冒險性。

5. 在免疫共沉淀實驗中要保證實驗結(jié)果的真實性,應(yīng)注意以下幾點:
(1)確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的,而并非外源非特異蛋白,單克隆抗體的使用有助于避免污染的發(fā)生;
(2)要確??贵w的特異性,即在不表達抗原的細胞溶解物中添加抗體后不會引起共沉淀;
(3)確定蛋白間的相互作用是發(fā)生在細胞中,而不是由于細胞的溶解才發(fā)生的,這需要進行蛋白質(zhì)的定位來確定。
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